تعتمد المدرسة في تقديم المناهج الدراسية على العلوم الإسلامية وعلوم أهل البيت ( ع ) بشكل معتدل  ووسطي وعلوم القرآن الكريم ، حيث يسعى مجلس إدارة الأوقاف الجعفرية الخيرية لتخريج أجيال متلزمة دينيا وثقافيا ووطنيا ولديها من الوعي الكافي لمواجهة التحديات بكافة أنواعها ، حيث تتفرع المواد الدراسية لتشمل علوم القرآن الكريم من تلاوة وتجود ، كما يتم تعليم الطلاب طرق الوضوء والصلاة ، وتنمية روح الإلتزام الديني والوطني في نفوسهم منذ نعومة أظفارهم ، ويقوم بكل هذه المهام فريق من المدرسين المتخصصين من أبناء وبنات الإمارات وتحت إشراف مباشر من مجلس إدارة الأوقاف الجعفرية الخيرية بدبي.